Ova nastavna cjelina pruža detaljan pregled čišćenja i dezinfekcije u prehrambenoj industriji, počevši od razumijevanja različitih vrsta nečistoća i općih protokola čišćenja. Nadalje, obuhvaća mokre i suhe postupke čišćenja, uključujući kemijska sredstvaCIP sisteme i tehnike pranja pjenom i gelom. Jedan dio posvećen je dezinfekciji opisujući karakteristike različitih biocida i metode dezinfekcije. Također se naglašava važnost validacije i kontrole postupaka čišćenja i dezinfekcije kroz SSOP i procjenu rizika, te se obrađuju primjeri uzorkovanja i kontrole čistoće. Laboratorijska vježba  obuhvaća kontrolu čišćenja brzom metodom ATP bioluminiscencije, a seminar obuhvaća izračune kod CIP sustava.